L’infection chronique au Sars-CoV-2 la plus longue connue des experts ? Cela a duré 613 jours. Un nouveau record dans le domaine Covid identifié par les experts du Cemm (Centre de Médecine Expérimentale et Moléculaire) du Centre Médical Universitaire (umc) d'Amsterdam. Magda Vergouwe et ses collègues de l'institut néerlandais ont décrit le cas d'un homme immunodéprimé de 72 ans qui a vécu avec le virus pandémique Covid pendant environ 1 an et 8 mois.
Et depuis longtemps que l’agent pathogène habite son organisme, celui-ci a eu l’occasion de beaucoup changer. À tel point que les experts soulignent le risque que se créent chez les « éternels positifs » des conditions (infections persistantes chez des patients sans défense) qui les rendent « moteur » pour le développement de nouvelles variantes potentiellement immunoevasives du Sars-CoV-2. L'étude illustrant la positivité du « Livre Guinness des records » sera présentée au Congrès mondial Escmid à Barcelone (27-30 avril).
Bien que rares, ces infections particulières pourraient conduire à une augmentation du nombre de mutations dans le génome du virus, affirment les auteurs, soulignant la nécessité d'une plus grande sensibilisation aux risques, d'une surveillance génomique étroite et de tests de diagnostic précoces pour les contacts symptomatiques dans le cadre de la gestion clinique. de ces patients.
La recherche décrit la vaste évolution virale observée dans ce cas qui, à leur connaissance, constitue « la plus longue durée d'infection par le Sars-CoV-2 à ce jour » enregistrée, bien que plusieurs cas de centaines de jours aient été enregistrés auparavant (les 505 derniers). . Pour donner une idée de l’actualité du sujet, on rappelle que le variant Omicron serait également originaire d’une personne immunodéprimée.
Le protagoniste de l'étude, âgé de 72 ans, n'a pas eu le temps de gagner sa bataille contre le virus et est décédé des suites d'une rechute de sa maladie hématologique. après être resté positif au Sars-CoV-2 avec une charge virale élevée pendant 613 jours. Il a été hospitalisé pour cette infection au centre d'Amsterdam en février 2022 et défini comme immunodéprimé en raison d'antécédents de greffe de cellules souches allogéniques dans le cadre du traitement du syndrome de chevauchement myélodysplasique et myéloprolifératif. Situation compliquée par un lymphome post-greffe pour lequel il a reçu du rituximab, un médicament qui épuise toutes les cellules B disponibles, y compris celles qui produisent normalement des anticorps dirigés contre le Sars-CoV-2.
L’homme avait déjà reçu plusieurs vaccins contre le Covid sans réponse mesurable en anticorps à son admission à l’hôpital. Les tests ont détecté la présence d’une infection variante Omicron BA.1.17. Et le patient a reçu divers traitements dont des monoclonaux sans obtenir de réponse clinique. Le séquençage du virus au cours de la phase de suivi a montré que déjà 21 jours plus tard, une mutation résistante à l'anticorps avec lequel le patient était traité s'était développée. Son système immunitaire s'est révélé incapable d'éliminer le virus au cours des semaines suivantes. L'infection prolongée et la vaste évolution virale possible dans son organisme ont conduit à l'émergence d'une nouvelle variante immunoevasive. Heureusement, il n’y a eu aucune transmission documentée du variant hautement muté dans la communauté, donc pas de cas secondaires.
L’homme a été confronté à plusieurs hospitalisations et à une infection persistante au Sars-CoV-2 l'a contraint à des périodes d'isolement prolongées pendant son hospitalisation et à un recours accru à des protections individuelles, ce qui a eu un impact sur sa qualité de vie, rapportent des experts. Un séquençage complet du virus a été réalisé sur 27 échantillons nasopharyngés, collectés de février 2022 à septembre 2023. L’analyse a révélé plus de 50 mutations nucléotidiques par rapport aux variantes contemporaines de BA.1 circulant dans le monde. En outre, plusieurs changements supplémentaires indiquant une fuite immunitaire se sont développés.
« Ce cas met en évidence le risque lié aux infections persistantes par le Sars-CoV-2 chez les personnes immunodéprimées », concluent cependant les auteurs, soulignant que « bien qu'il puisse y avoir un risque accru de développer de nouvelles variantes, toutes » celles qui apparaissent dans ces patients « évolueront vers un nouveau variant préoccupant (VOC) pour la communauté. Les mécanismes sous-jacents à l’émergence d’un VOC sont beaucoup plus complexes et dépendent également de facteurs dans la population entourant le patient », dont l’immunité.
« Les durées d’infection par le Sars-CoV-2 décrites dans ce cas sont extrêmes, mais elles sont beaucoup plus fréquentes chez les personnes immunodéprimées que dans la communauté en général. Des travaux ultérieurs de notre équipe ont décrit une cohorte de ces patients avec des durées d’infection incluses. une fourchette allant de 1 mois à 2 ans ».
