L’hypermuté Ba.2.87.1, le variant isolé en Afrique du Sud, est déjà sous surveillance. Dans une mise à jour du 2 février, le Centre européen de contrôle des maladies (ECDC) a classé le nouveau venu comme variante à surveiller. Découvert en Afrique du Sud, entre mi-septembre et mi-novembre 2023, par le même groupe de scientifiques qui a détecté pour la première fois Omicron et identifié sous l’acronyme Ba.2.87.1, il présente plus de 100 mutations dont plus de 30 dans la protéine Spike. Selon les experts qui ont commencé à l’étudier, il est génétiquement distinct des lignées Omicron actuellement en circulation (notamment Ba.2.86 et JN.1). Le degré de transmissibilité et de pathogénicité reste à évaluer.
Les caractéristiques de Ba.2.87.1
« Il s’agit d’une nouvelle lignée de Sars-CoV-2 avec plus de 100 mutations provenant d’Afrique du Sud », explique Tulio de Oliveira, directeur du Centre de réponse aux épidémies et d’innovation de l’Université de Stellenbosch, qui l’a identifiée. « C’est probablement la lignée la plus divergente identifiée cette année », ajoute-t-il. La variante a été détectée entre la mi-septembre et la mi-novembre 2023 : « Elle est génétiquement distincte des lignées Omicron actuellement en circulation (en particulier BA.2.86 et JN.1) – écrit de Oliveira – et la première analyse suggère qu’elle est probablement issue de Ba .2 ou du nœud basal d’Omicron ».
Comment est-il né ? « L’hypothèse la plus plausible, comme dans le cas du Ba.2.86, serait une infection chronique suivie d’une transmission dans la population, dans laquelle elle circulerait sans être détectée. Cependant, on ne peut pas non plus exclure l’hypothèse d’un réservoir animal. »
« Le degré de transmissibilité et la pathogénicité sont encore inconnus – continue de Oliveira -. Pour déterminer l’étendue de cette nouvelle lignée, l’Afrique du Sud a augmenté la surveillance génomique, et pour le moment il y a très peu de signes indiquant qu’elle se propage à grande échelle et puisse remplacer la la variante dominante actuelle JN.1 ». Ba.2.87.1 n’est pas une préoccupation pour l’instant. En Afrique du Sud, où il a été découvert et circule depuis un certain temps déjà, les infections restent faibles. Par ailleurs, « les analyses préliminaires indiquent que Ba.2.87.1 est moins immunoévasif que Jn.1. Il doit produire des mutations supplémentaires pour rester compétitif », note Raj Rajnarayanan, chercheur et professeur agrégé au Nyitcom de l’Université de l’Arkansas.
