Après des mois de silence substantiel, le Covid fait à nouveau la une des journaux. L’alerte est venue de France, où l’on a constaté une forte augmentation des cas. Mais que se passe-t-il réellement au-delà des Alpes ? Et à quoi devons-nous nous attendre en Italie et dans le reste de l’Europe ? Essayez de dresser un portrait chez Adnkronos Health de Federico Gueli, le « chasseur » italien de variants qui, après l’expérience accumulée au moment de la pandémie, continue depuis des années à suivre l’évolution du virus Sars-CoV-2, essayant de prédire ses trajectoires même aujourd’hui où les prélèvements, les prélèvements et le séquençage se sont effondrés presque partout. En examinant tout d’abord les données des deux réseaux de surveillance français, l’expert précise : « Les deux rapports mettent en évidence une augmentation des cas fin septembre, par rapport à la semaine précédente, mais il faut être très clair : nous partons d’une situation de circulation très faible. Il faut garder à l’esprit que les niveaux actuels ne sont pas supérieurs à ceux de l’année dernière à la même période. réouverture des écoles ».
Super propagation et contagiosité, ce qui a changé par rapport au passé
Pourquoi le scénario, comme l’explique Gueli, est-il différent de celui observé avant 2024 ? « Pour comprendre cela, il faut partir des variants du Covid qui sont actuellement considérés comme ‘sous surveillance’ (Vum) par l’Organisation mondiale de la santé. L’OMS en voit 4 : le recombinant PQ.16.1.1, un variant né en Chine, évolution du NB.1.8.1, qui a donné lieu à plusieurs vagues épidémiques assez importantes non seulement dans le géant asiatique mais aussi dans d’autres pays de la région de Hong Kong à Singapour, en partie en Corée du Sud ainsi que d’autres variants, en Thaïlande et à Taiwan. La dernière variante avec sa mutation principale D420N a vaincu les autres concurrents qui circulaient en Asie à cette époque et est devenue dominante. Elle a provoqué une vague qui a culminé à partir du milieu et de la fin de l’été dans tous les pays asiatiques et qui est maintenant en déclin. Cette variante est arrivée en Europe, aux États-Unis, mais aussi en Océanie et n’a pratiquement rien fait, elle n’a probablement pas montré d’avantage, sa capacité à échapper à l’immunité était probablement très spécifique à cette région (caractérisée par des vaccins initiaux différents, des confinements plus sévères lors de la première vague et maintenu). plus longtemps).
Le fait est, analyse Gueli, qu’« après le printemps 2025 – lorsque XFG et NB.1.8.1 se sont imposés à l’échelle mondiale (ce dernier avec une forte prévalence surtout en Asie et en Océanie) – pendant toute la période suivante, il n’y a plus eu de variante qui a réussi à s’imposer au niveau mondial. La variante sud-africaine qui risquait de s’éteindre et qui a commencé à se faire sentir l’hiver dernier en Europe, en Australie et en Océanie, BA.3.2 semble avoir une capacité supérieure à infecter les enfants et son action sur les enfants a supprimé une réserve fondamentale de circulation pour tous les agents respiratoires, obligeant les autres variantes à évoluer. D’un autre côté, même XFG, qui était plus répandu en Europe et en Amérique, a dû évoluer pour rivaliser avec BA.3.2 et nous avons ainsi vu des versions avec 3 à 5 mutations ou plus dans la protéine Spike. (avec lequel le virus attaque la cellule) prennent le relais des anciennes. » Qu’est-ce qui cause l’augmentation des cas localement ? « Nous assistons actuellement à un remaniement de divers variants qui n’ont que partiellement envahi l’ancienne génération, en ajoutant 3-4 mutations par rapport à leurs géniteurs, ce qui les rend probablement plus évasifs – dit Gueli -. Ce caractère évasif a cependant probablement un coût en termes d’infectiosité. Et aujourd’hui, nous constatons que la capacité de ces variants à créer des « événements de super propagation » (situations dans lesquelles, par exemple, dans un stade, des dizaines de milliers de personnes tombent malades) est bien inférieure à celle avant, à la fois parce que l’immunité est plus grande, et à la fois à cause de mutations.
Dans les rapports des organismes publics, poursuit Gueli, « tous les sous-variants qui ont eu un avantage au cours de cette période ont été quelque peu perdus, également parce qu’ils sont très locaux et difficiles à situer dans la tendance. Pour le moment, la situation est très équilibrée et fragmentée : dans différents pays, il existe différentes variantes, le virus ne semble pas avoir la force et l’espace pour assumer des mutations qui donnent d’énormes avantages compétitifs, comme pouvoir infecter une grande partie de la population en peu de temps. et aussi l’attention médiatique a diminué, à mesure que le moment d’urgence est passé. Nous n’avons pas vu de vagues mondiales généralisées depuis 2024. Nous avons eu des pics, avec une tendance à une diffusion mondiale, mais moins coordonnée et avec certains pays enregistrant des phases de 12 mois sans vagues ». D’autre part, il convient de rappeler que « surtout dans les pays asiatiques, il y a eu des épidémies importantes avec des hospitalisations et des décès, mais non comparables à celles d’avant 2024. Par conséquent, si d’un point de vue médical il est évidemment important de savoir quoi et comment cela circule » et d’être vigilant, « dans une analyse générale, il faut toujours relativiser sur le moment réel : nous avons une croissance, mais pas impétueuse ou exceptionnelle ».
Covid en Europe, quels pays enregistrent une augmentation des cas
Quelle est la situation en Europe ? « Le tableau n’est pas clair pour le moment – observe Gueli – Tout d’abord, il y a peu de données, peu de séquences. La plupart des données européennes viennent d’Espagne, où il y a certainement une vague en cours qui cependant ne fait pas l’actualité. Nous constatons des augmentations en France, en Belgique, au Luxembourg, en Irlande et au Royaume-Uni où nous sommes dans une phase initiale. Au niveau européen aujourd’hui, nous voyons principalement 4-5 variantes. Deux proviennent de XFG, et pour la quatrième, il y a encore peu de données dans l’Ancien Continent, dans le sens où la présence est détectée à la fois en Angleterre et en Espagne, mais pas dans d’autres pays. Les deux variantes de XFG (TA.1 et TK.1) ont des mutations différentes, mais il n’y a aucune raison de penser qu’elles ont un niveau de gravité plus élevé. En particulier, nous avons en Espagne une autre variante dérivée qui présente actuellement des risques.
PJ.2.1, la nouvelle variante « spéciale gardée »
Et puis il y a ce que Gueli définit comme « l’observation particulière ». « Il s’agit d’une nouvelle variante de « saltation » que nous avons tracée dès le premier patient, ce qui est unique car elle nous a également permis d’étudier la dynamique dont elle est issue et tout son parcours. L’analyse part d’un cas d’infection chronique que mon collègue Ryan Hisner retraçait dans un hôpital de l’Ontario depuis la fin de 2025 (une personne qui était malade et s’est rendue plusieurs fois chez le médecin, qui a trouvé le test positif et toujours la même variante qui a continué à muter). PJ.2.1 et chez ce patient, il a acquis 20 mutations. Soudainement à partir de janvier, il a commencé à circuler à de faibles niveaux, probablement dans le même hôpital, dans les infections hospitalières. Puis à partir de mai, il a commencé à circuler dans la population, peut-être aussi en correspondance avec la Coupe du monde qui s’est déroulée en Amérique, nous l’avons vu arriver à New York, et nous avons commencé à le voir se propager assez rapidement en Amérique mais dans une mesure limitée également dans le monde : en Colombie et à Cuba, à travers les voyageurs arrivant aux États-Unis, et en Espagne, aux Pays-Bas, en Angleterre, mais. aussi en Australie et à Singapour. Il est donc en expansion. Il est vrai qu’il ne connaît pas une explosion comme les précédentes, mais sa prévalence augmente dans les pays où il se développe. Il y a deux ans, nous aurions dit : « Il pourrait devenir dominant ». Mais maintenant, la dynamique est si compliquée que nous nous limitons à signaler sa présence sur la scène dans un « timing » avantageux. bassin ». L’un des principaux experts des variantes du Covid, Yunlong Cao, l’a déjà étudié, « et a constaté qu’il n’est pas plus évasif que les autres, mais qu’il a une capacité de « liaison » supérieure, à se lier à la cellule humaine. Cela nous fait penser que, s’il évoluait davantage tout en maintenant un équilibre favorable, il pourrait avoir un impact – conclut Gueli – Il doit donc être surveillé même si rien ne nous fait penser qu’il soit actuellement lié à l’augmentation des cas en France, ni à la croissance relative observée dans le pays. dernières mises à jour en Italie, notamment dans les régions de Lombardie, de Vénétie, du Latium et de Campanie, qui sont généralement les premières à mettre en œuvre les nouvelles variantes ».
