Un nouveau variant du Covid fait son apparition sur la scène internationale. Il a été découvert en Afrique du Sud par le même groupe de scientifiques qui a détecté Omicron pour la première fois et a déjà été identifié sous l’acronyme Ba.2.87.1. Il s’agit d’un variant hypermuté : il présente en réalité plus de 100 mutations, dont plus de 30 dans la protéine Spikeexperts sur le point culminant de X.
« 8 génomes d’une nouvelle lignée du Sars-CoV-2, avec plus de 100 mutations, ont été déposés depuis l’Afrique du Sud. C’est probablement la lignée la plus divergente identifiée cette année », explique Tulio de Oliveira, directeur du Centre d’épidémie. réponse et innovation à l’Université de Stellenbosch, qui l’a identifié. Le chercheur illustre quelques caractéristiques principales de la nouvelle lignée, initialement baptisée Ba.2.X. Le variant a été détecté entre mi-septembre et mi-novembre 2023 : « C’est génétiquement distinct des lignées Omicron actuellement en circulation (en particulier BA.2.86 et JN.1) – écrit de Oliveira – et la première analyse suggère qu’il est probablement apparu à partir de Ba.2 ou du nœud basal d’Omicron ». Comment est-il apparu ? « Le plus plausible, comme dans le cas du Ba.2.86, il s’agirait d’une infection chronique suivie d’une transmission dans la population, dans laquelle elle a circulé sans être détectée. Cependant, nous ne pouvons pas non plus exclure lehypothèse d’un réservoir animal« .
« Le degré de transmissibilité et la pathogénicité sont encore inconnus – continue de Oliveira -. Pour déterminer l’étendue de cette nouvelle lignée, l’Afrique du Sud a augmenté la surveillance génomique, et pour le moment il y a très peu de signes indiquant qu’elle se propage à grande échelle et puisse remplacer la la variante dominante actuelle JN.1 ». Ba.2.87.1 n’est pas une préoccupation pour l’instant. En Afrique du Sud, où il a été découvert et circule depuis un certain temps déjà, les infections restent faibles. Par ailleurs, « les analyses préliminaires indiquent que Ba.2.87.1 est moins immunoévasif que Jn.1. Il doit produire des mutations supplémentaires pour rester compétitif », note Raj Rajnarayanan, chercheur et professeur agrégé au Nyitcom de l’Université de l’Arkansas.
Ciccozzi : « Nouvelle variante à garder sous contrôle »
Le nouveau variant, identifié en Afrique du Sud, « qui fait toujours partie de la famille Omicron et semble dériver de Ba.2 », il doit absolument être surveillé et maîtrisé. Espérons que cela ne devienne pas répandu » dit l’épidémiologiste Massimo Ciccozzi à Adnkronos Salute. Selon l’expert, Ba.2.87.1 « est une variante intéressante car elle présente de nombreuses mutations, plus de 100, mais ce qui frappe, c’est celle de cette centaine au moins 32 semblent être sur la protéine Spike », la clé qui permet au virus de pénétrer dans les cellules. « Non seulement cela. Ce sont des mutations non synonymes – explique Ciccozzi – c’est-à-dire qu’il y a le remplacement d’un acide aminé par un autre totalement différent. Cela indique une évolution importante du virus. De plus, la variante présente 7 délétions, donc précisément les morceaux du virus : 3 sont sur la protéine Spike et 2 de ces 3 ont au moins une délétion de 10 acides aminés importants sur le segment qui sert à la reconnaissance des anticorps. Cela fait aussi partie de l’évolution du virus, qui sacrifie une partie d’elle-même pour échapper au système immunitaire. Les délétions sont donc extrêmement plus importantes que même les mutations non synonymes. En bref, la nouvelle lignée du Sars-Cov-2 doit être surveillée et gardée sous contrôle », commente-t-il. .
Pregliasco : « Nouvelle variante hypermutée ? Tous les 4 à 6 mois, il y en aura une autre »
La nouvelle « version » du Sars-CoV-2, avec plus de 100 mutations dont plus de 30 dans la protéine Spike, faut-il s’inquiéter ? « Il est trop tôt pour le dire« , répond le virologue de l’Université d’État de Milan à Adnkronos Salute Fabrizio Pregliasco. « Comme toujours, une surveillance constante sera importante », recommande-t-il. Aussi parce que, précise-t-il, « nous sommes désormais dans une phase calme, mais le Covid restera à nous déranger » et petit à petit différents variants passeront le relais : « De manière cyclique, tous les 4 à 6 mois, de nouveaux arriveront« , réitère l’expert. Cependant, il ira avec BA.2.87.1, pour Pregliasco « l’apparition de cette autre nouvelle variante souligne comment le Covid reviendra avec un caractère cyclique qui, contrairement à ce qui se passe avec la grippe – souligne-t-il – pas forcément lié à l’hiver et aux facteurs qui ont alimenté cette dernière saison la circulation d’un cocktail viral particulièrement important ». D’où le mot d’ordre : « La surveillance » continue, sans jamais baisser la garde.
Rezza : « Le variant hypermuté n’est pas féroce, il ne perce pas les vaccins et l’immunité »
Le nouveau variant du Sars-Cov-2, identifié en Afrique du Sud et baptisé Ba.2.87.1, « ne semble pas inquiétant pour le moment ». Selon les premières indications, en effet, « il semblerait moins capable d’« échapper » à l’immunité et aux vaccins que le virus Whan. Tant les vaccinations que les infections reçues sembleraient donc pouvoir protéger davantage contre cette nouvelle variante. . Et cela s’expliquerait par le fait que cela ne se propage pas rapidement », a-t-il déclaré à Adnkronos Salute. Giovanni Rezzaancien directeur de la Prévention au Ministère de la Santé et aujourd’hui professeur extraordinaire d’hygiène à l’Université Vita-Salute San Raffaele de Milan.
Ba.2.87.1, en effet, « il est détecté depuis quelques mois maintenant mais ne semble pas assez « féroce » pour remplacer les précédents. En théorie, ce n’est donc pas dangereux ». Rezza souligne également que « nous avons toujours affaire à la famille d’Omicron. Cette variante hypermutée est similaire à Ba.2, la « mère » d’une large population d' »enfants ». C’est également pour cette raison « qu’elle ne devrait pas susciter d’inquiétude au niveau clinique, elle fait partie de la ‘soupe de variantes’ générée par Omicron ». Le fait qu’il soit identifié en Afrique du Sud n’est pas surprenant car « dans les pays où vivent de nombreuses personnes immunodéprimées – comme l’Afrique du Sud où le VIH est répandu – des infections chroniques surviennent et le virus a tendance à évoluer au sein d’une même personne. Il donne alors naissance à une série de sous-variants ou de nouvelles lignées, dans une sorte de boîte de jeu chinoise continue. De là, de nouvelles vagues épidémiques peuvent surgir lorsque le variant n’est pas reconnu par les anticorps générés par le précédent. Dans ce cas, il tend à le remplacer. Cependant, les nouvelles vagues – conclut-il – ne sont plus trop intenses et ne génèrent pas un impact clinique élevé ».
Lopalco : « Le virus va continuer à muter, défendons-nous avec des vaccins »
« Le Coronavirus va continuer à muter parce que c’est ce qui permet à son espèce de survivre » Santé est Pier Luigi Lopalco, professeur d’hygiène à l’Université du Salento, explique à Adnkronos. « L’espèce humaine sait cependant se défendre contre les anciens et les nouveaux variants : nous disposons de vaccins sûrs et efficaces. Utilisons notre cerveau et faisons-nous vacciner. » Pour Lopalco, il n’y a pas de surprises ni de nouvelles inquiétudes particulières : « La découverte d’une nouvelle variante – souligne-t-il – est une chose à laquelle nous devons nous habituer. Dans le domaine de la grippe, ce type de surveillance existe depuis des décennies et n’a jamais été réalisé. fait l’actualité ».
Ricciardi : « La peur n’est pas une nouvelle variante, mais un virus qui continue de tuer »
« Il n’y a aucune raison particulière de s’inquiéter concernant la nouvelle variante du Sars-Cov-2 identifiée en Afrique du Sud, Ba.2.87.1. » Walter Ricciardi raconte Adnkronos Salute. « Il faut du temps pour comprendre son évolution. Mais plus généralement, il faut quand même s’inquiéter du Covid car il continue de frapper lourdement, avec des milliers de morts dans le monde. Rien qu’en Italie, nous restons au-dessus de 100 décès par semaine. E’ una situazione da tenere ancora sotto controllo sia per la prevenzione sia per la gestione del Long Covid che riguarda milioni di persone ». Per quanto riguarda Ba.2.87.1 « succede regolarmente che vengano isolate nuove varianti, non c’è niente di neuf. Ce dernier est un peu plus médiatique car il vient d’Afrique du Sud, un pays qui nous a déjà réservé quelques surprises, avec l’isolement du premier Omicron », ajoute Ricciardi. Tandis que, en ce qui concerne les données hebdomadaires de Covid, qui font état de 115 décès en un semaine, en baisse de 43%, Ricciardi note que « si avant Covid on nous avait parlé d’une maladie qui provoque 100 décès par semaine, nous aurions été alarmés ». Maintenant, nous sommes heureux car nous constatons le déclin de la courbe. C’est une question d’attitude qui se caractérise aujourd’hui par l’éloignement. »
